More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1632 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 286 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  98.95 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  82.39 
 
 		 286 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  66.67 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  64.64 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  68.5 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  64.64 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  63.38 
 
 		 294 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  60.29 
 
 		 293 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  55.94 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  48.71 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  53.46 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  45.67 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  42.07 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  45.11 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.93 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  45.02 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  48.29 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  46.58 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  38.43 
 
 		 288 aa  215  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  40.67 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  50.69 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  41.79 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  48.1 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  42.11 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  44.58 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  47.39 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.21 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  39.52 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  44.49 
 
 		 291 aa  208  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  44.48 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  39.24 
 
 		 322 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  43.87 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  36.94 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  45.8 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  40.77 
 
 		 287 aa  204  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  45.38 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  36.94 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.46 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  36.94 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  36.94 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  44.44 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  44.54 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  43.31 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  44.44 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  45.53 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  44.12 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  44.67 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  44.67 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  44.26 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  45.42 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  45.65 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  44.67 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  42.53 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  42.53 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  42.53 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  41.22 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  42.53 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  42.53 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  38.06 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  44.71 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  43.7 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  40.93 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  38.38 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  45.21 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  45.2 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  42.73 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  38.71 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  36.71 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  42.92 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  43.28 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  44.9 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  42.49 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  45.66 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  45.66 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  37.63 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  43.22 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  42.69 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  42.69 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  41.6 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  42.69 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  44.87 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  41.6 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2189  2-methylisocitrate lyase  42.31 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  41.6 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  41.6 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  38.7 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  42.29 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  41.53 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  42 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  44.64 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  41.22 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  46.35 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  38.06 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  41.13 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  44.44 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  40.94 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  44.44 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  41.9 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.59 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>