More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2270 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
326 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  94.79 
 
 
326 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  94.48 
 
 
326 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  66.46 
 
 
331 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  64.81 
 
 
325 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  62.96 
 
 
325 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  62.65 
 
 
325 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  62.96 
 
 
324 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  61.54 
 
 
327 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  61.23 
 
 
327 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  59.88 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  60.55 
 
 
325 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  58.2 
 
 
331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  59.74 
 
 
351 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  57.1 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  54.94 
 
 
324 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  54.94 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  54.63 
 
 
329 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  54.63 
 
 
329 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  54.63 
 
 
329 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  53.66 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  53.01 
 
 
337 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  54.32 
 
 
329 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 
332 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 
332 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 
332 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  50.93 
 
 
332 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  50.31 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  50 
 
 
332 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  47.37 
 
 
324 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  49.38 
 
 
332 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  45.89 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  44.76 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  46.11 
 
 
337 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  44.27 
 
 
326 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  45.29 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  43.21 
 
 
353 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  44.97 
 
 
332 aa  268  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  46.11 
 
 
335 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 
325 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.02 
 
 
335 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  46.77 
 
 
324 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  44.62 
 
 
325 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  41.88 
 
 
325 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  41.95 
 
 
342 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  41.36 
 
 
324 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  40.74 
 
 
324 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  40.49 
 
 
326 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  42.73 
 
 
336 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  42.99 
 
 
323 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  44.1 
 
 
335 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  42.35 
 
 
336 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  43.79 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  39.63 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  43.79 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  46.67 
 
 
447 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  58.38 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  35.85 
 
 
327 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  38.39 
 
 
336 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  41.64 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  39.31 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  36.76 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.92 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
329 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.16 
 
 
311 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.85 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 
309 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
322 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  32.28 
 
 
341 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
316 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 
306 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 
312 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
316 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.33 
 
 
335 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 
311 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 
298 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
314 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.74 
 
 
310 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
323 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 
318 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  30.38 
 
 
316 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.79 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 
345 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.3 
 
 
302 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 
307 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
312 aa  95.9  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  29.09 
 
 
313 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>