200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1187 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  88.7 
 
 
405 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  89.19 
 
 
405 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  25.27 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
376 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
397 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
397 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
780 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  24.74 
 
 
383 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
392 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 
383 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  24.67 
 
 
378 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  26.15 
 
 
381 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  24.74 
 
 
383 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 
383 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.1 
 
 
399 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  23.3 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 
381 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 
382 aa  93.2  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  23.39 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  26.22 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.29 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  22.74 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 
384 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 
377 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 
496 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25.83 
 
 
374 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.82 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.46 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  23.83 
 
 
293 aa  84  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  30.84 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  24.42 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  27.14 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.26 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  22.31 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  21.02 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  26.51 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  22.86 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  23.48 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  25.4 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.1 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.68 
 
 
384 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  25.71 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  23.61 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.77 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  26.78 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.69 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.31 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.69 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.97 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  20.57 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  22.44 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  24.86 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.19 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  26.67 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  22.96 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  22.56 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.4 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  27.04 
 
 
691 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  25.93 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  24.66 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.31 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.76 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.96 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.72 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.54 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.02 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>