87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0891 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  42.19 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  41.41 
 
 		 253 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  41.41 
 
 		 253 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  42.96 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  39.55 
 
 		 254 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  40 
 
 		 194 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  45.59 
 
 		 198 aa  89.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 440 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  38.81 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  42.54 
 
 		 197 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  40.46 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  40.15 
 
 		 391 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 		 401 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  42.22 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  36.96 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  41.79 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  36.23 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 370 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  38.85 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.03 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  37.59 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  41.79 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.24 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.48 
 
 		 382 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.76 
 
 		 452 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.76 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  36.09 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  38.81 
 
 		 383 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 411 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.29 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 378 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.15 
 
 		 427 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.76 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  42.54 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.85 
 
 		 364 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  32.61 
 
 		 313 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.6 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  34.04 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  33.54 
 
 		 376 aa  62  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  33.58 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  35.66 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  31.54 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  31.54 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  33.58 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  31.11 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  33.58 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  32.84 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  33.82 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  32.09 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  28.89 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  28.57 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  40.58 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  28.89 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  34.59 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  28.36 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  37.18 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  50.98 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  35 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  38.04 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  32.17 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  28.15 
 
 		 209 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  32.98 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  34.17 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  37.63 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  38.71 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  34.41 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  27.94 
 
 		 2805 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  28.21 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  27.19 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  38.27 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  36.9 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1509  hypothetical protein  35.87 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.600334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  37.18 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>