More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0924 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  61.71 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  61.21 
 
 		 231 aa  278  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  57.34 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  52.34 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  46.05 
 
 		 250 aa  211  4.9999999999999996e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  48.34 
 
 		 286 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  45.98 
 
 		 276 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 273 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  49.3 
 
 		 282 aa  204  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  45.16 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  49.32 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  49.77 
 
 		 289 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  42.6 
 
 		 352 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  48.13 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  46.73 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  45.85 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  46.73 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  45.62 
 
 		 293 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  46.36 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  46.26 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  45.33 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  49.08 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 269 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  45.16 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  44.91 
 
 		 284 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  43.66 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  44.88 
 
 		 288 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.34 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  48.57 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  42.73 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  41.71 
 
 		 303 aa  191  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  40.76 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  46.89 
 
 		 303 aa  191  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  44.76 
 
 		 312 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  45.45 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  43.54 
 
 		 279 aa  190  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  44.91 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  43.72 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  43.26 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  45.97 
 
 		 318 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  44.13 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  42.52 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  44.19 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  45.67 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  42.52 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  41.71 
 
 		 216 aa  188  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.39 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  41.78 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  44.86 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  41.78 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  43.78 
 
 		 280 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.93 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  41.23 
 
 		 292 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  42.33 
 
 		 307 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  43.4 
 
 		 300 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  43.06 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  41.47 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  45.37 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  44.24 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  44.24 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  47.71 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 		 267 aa  184  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  42.72 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  42.52 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  42.45 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  44.6 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  43.13 
 
 		 326 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  44.44 
 
 		 407 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  41.47 
 
 		 321 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  41.59 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 322 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  39.73 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  46.23 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  42.72 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  43.72 
 
 		 268 aa  181  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 283 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  42.99 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.87 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.87 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.87 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.87 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  43.98 
 
 		 394 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>