More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0476 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  48.85 
 
 		 281 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  57.69 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  57.69 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  50.36 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  51.08 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  49.63 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  49.29 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  52.55 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  51.18 
 
 		 204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  51.54 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  54.96 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  48.99 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  43.87 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  50 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  51.67 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  52.67 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  52.21 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  45.39 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.59 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  50.81 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  48.36 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  47.62 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  49.62 
 
 		 198 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  49.65 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  51.26 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  43.07 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  52.03 
 
 		 202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  43.02 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  52.07 
 
 		 221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  51.11 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.54 
 
 		 438 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  54.17 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  49.61 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  45.19 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 191 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 		 203 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  49.61 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  49.29 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  50.85 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  43.33 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  43.03 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  49.19 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  47.93 
 
 		 174 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  48.48 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  46.31 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 199 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.72 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.59 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  48.08 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  52.59 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  54.39 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  41.76 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  43.61 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  47.89 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  55.65 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  46.9 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  41.53 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  44.63 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  51.33 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  44.27 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  51.61 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  45.16 
 
 		 196 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  47.62 
 
 		 194 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  45.97 
 
 		 314 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 		 146 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  49.6 
 
 		 210 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  47.86 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  45.71 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  46.09 
 
 		 194 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  47.11 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  47.86 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  47.29 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 332 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  47.11 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  43.94 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>