More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0923 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 
370 aa  738    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.58 
 
 
392 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  27.78 
 
 
409 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  30.37 
 
 
380 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  30.92 
 
 
389 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 
418 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.49 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  27.11 
 
 
418 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  33.53 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  32.01 
 
 
538 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  31.16 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 
554 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.9 
 
 
418 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.75 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  33.04 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  30.95 
 
 
401 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
421 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
426 aa  123  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  25.44 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.48 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.23 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.3 
 
 
420 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.94 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.72 
 
 
420 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.38 
 
 
420 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.72 
 
 
420 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.72 
 
 
420 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.3 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.72 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.72 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.49 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.14 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.92 
 
 
440 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  24.1 
 
 
393 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  25.69 
 
 
415 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 
419 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.41 
 
 
429 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.35 
 
 
440 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
484 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1555  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.08 
 
 
535 aa  105  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.91 
 
 
428 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2662  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  29.91 
 
 
394 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1281  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.03 
 
 
393 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.679748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.44 
 
 
438 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 
448 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26 
 
 
434 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1354  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.79 
 
 
407 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1384  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.08 
 
 
407 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
430 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
431 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 
409 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 
418 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 
418 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1584  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.17 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.495225  unclonable  0.000000222283 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  27.81 
 
 
387 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1979  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.84 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.495499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.07 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  27.23 
 
 
466 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 
484 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2008  tRNA synthetase class II (G H P and S)  28.78 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00513827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.45 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
470 aa  94  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1206  ATP phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
326 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2586  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.33 
 
 
397 aa  93.2  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.368474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2297  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  28.65 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.7 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5010  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.49 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.78 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  31.69 
 
 
349 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0606  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.48 
 
 
321 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.35 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
349 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.17 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
377 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.33 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  31.98 
 
 
349 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  23.45 
 
 
536 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4938  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit, putative  28.21 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.46 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.69 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.77 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29 
 
 
385 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.74 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 
418 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.83 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3163  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  29.26 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902374  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.14 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
456 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  25.93 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.62 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.05 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>