More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0065 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  100 
 
 
136 aa  270  4e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  100 
 
 
136 aa  270  4e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.11 
 
 
145 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.19 
 
 
152 aa  112  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.41 
 
 
148 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1251  biopolymer transport protein TolR  47.41 
 
 
152 aa  111  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.134636  normal  0.986212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.21 
 
 
144 aa  109  1e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.01992e-05  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.21 
 
 
144 aa  109  1e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.32796e-06  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  44.03 
 
 
146 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.62 
 
 
148 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  45.26 
 
 
148 aa  107  8e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 
154 aa  106  9e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  45.04 
 
 
142 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  42.86 
 
 
142 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.00528e-05  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  45.07 
 
 
150 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.07 
 
 
145 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 
144 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.81876e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 
147 aa  103  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  40.15 
 
 
150 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  44.37 
 
 
150 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.11 
 
 
142 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.55119e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 
149 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  42.54 
 
 
139 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  48.12 
 
 
147 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  48.12 
 
 
147 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 
149 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  45.11 
 
 
144 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.3737e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  41.26 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.26 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  41.09 
 
 
150 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  41.09 
 
 
150 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  42.66 
 
 
150 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  44.37 
 
 
150 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  44.37 
 
 
150 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  45.11 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.62541e-07  hitchhiker  2.51452e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.11 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.76409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  45.11 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.88711e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  43.8 
 
 
149 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  43.8 
 
 
149 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  43.88 
 
 
146 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  43.88 
 
 
146 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  1.69267e-05 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  43.8 
 
 
149 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  44.36 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.08666e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.26 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.2 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  46.32 
 
 
151 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  43.8 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  44.78 
 
 
145 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  46.32 
 
 
151 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  43.8 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  42.64 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  43.8 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  43.8 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  43.18 
 
 
147 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  42.86 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  1.79602e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  46.21 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  43.61 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.89995e-06  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  43.07 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.25 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  41.79 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  38.28 
 
 
149 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  39.1 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  9.48089e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2585  protein TolR  40.15 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  40.15 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  40 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  39.42 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.1299e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2716  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.11 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0557943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  37.21 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  39.53 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  40.15 
 
 
138 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0896  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.62 
 
 
151 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.38629e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  36.22 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  43.08 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  36.22 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0947  protein TolR  38.24 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.324869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0761  protein TolR  42.86 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.156142  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  39.55 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  43.28 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  35.66 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  37.8 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  42.03 
 
 
141 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  39.68 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>