More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1057 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1057  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2321  hypothetical protein  95.65 
 
 
69 aa  133  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2878  hypothetical protein  73.53 
 
 
68 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2740  hypothetical protein  73.53 
 
 
68 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
69 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  60.87 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2787  cold shock domain-contain protein  64.18 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.074349  hitchhiker  0.00762568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2407  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0284217  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2477  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.916903  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2569  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.608616  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.61 
 
 
69 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.61 
 
 
69 aa  84.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0435864  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2285  cold-shock protein, DNA-binding  62.69 
 
 
69 aa  84.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1128  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4313  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1572  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.42 
 
 
69 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
68 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.88 
 
 
71 aa  84  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1693  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
68 aa  84.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1708  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
69 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000316023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4145  cold shock protein CapB  62.32 
 
 
69 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3884  cold-shock protein, DNA-binding  62.32 
 
 
69 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.218294  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1201  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.32 
 
 
69 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2659  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 
69 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00019694  hitchhiker  0.00182123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1748  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
69 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 
69 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000671273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
69 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  56.52 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1099  cold-shock domain-contain protein  60.29 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0660556  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  57.97 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.87 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.970454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2160  cold-shock protein, DNA-binding  60.87 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233344  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.71 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1139  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159877  normal  0.955199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.42 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  60 
 
 
70 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.71 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1970  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00428125  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  55.07 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  59.7 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.9 
 
 
66 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.97 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.61 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.57 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  55.07 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17950  Cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.42 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.93 
 
 
66 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.69 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2376  cold shock domain family protein  57.97 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.85246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  55.88 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  57.14 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.24 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  57.97 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  58.82 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  58.82 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  54.29 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1855  cold acclimation protein B  59.42 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386681  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  58.82 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21760  cold acclimation protein B  59.42 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342335  normal  0.456476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  54.29 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.71 
 
 
70 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 
66 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  58.82 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  55.88 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  55.88 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  55.88 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  55.88 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  55.88 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  55.88 
 
 
69 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  56.72 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  54.29 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  55.38 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  57.35 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  60.66 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.29 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  63.33 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00522  cold shock protein  56.52 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  60.66 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  63.33 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.57 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  60.66 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  52.31 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  55.22 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>