More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2878 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2878  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2740  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2321  hypothetical protein  75 
 
 		 69 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1057  hypothetical protein  73.53 
 
 		 69 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0613  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 71 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.513087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0531  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.86 
 
 		 70 aa  94  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0526  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 		 70 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0898507  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00215125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0792  cold shock protein  63.77 
 
 		 69 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000000912185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.77 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.77 
 
 		 69 aa  86.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  64.18 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  65.22 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2160  cold-shock protein, DNA-binding  63.77 
 
 		 70 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  68.75 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  64.18 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  65.67 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1977  cold shock-like protein CspC  68.75 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  65.67 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1625  cold-shock DNA-binding domain protein  60.87 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.778402  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1855  cold acclimation protein B  59.42 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  67.19 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21760  cold acclimation protein B  59.42 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342335  normal  0.456476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  67.19 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  67.19 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06418  hypothetical protein  62.69 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  67.19 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.43 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  70.49 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  61.43 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.67 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  59.42 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0306  cold shock domain-contain protein  62.69 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.751232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2609  cold-shock protein, DNA-binding  56.52 
 
 		 69 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4145  cold shock protein CapB  60.87 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3884  cold-shock protein, DNA-binding  60.87 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.218294  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4313  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1201  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.87 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1128  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1407  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.42 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.970454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0737  cold shock DNA-binding domain-containing protein  59.42 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2376  cold shock domain family protein  60.87 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.85246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  65.62 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 68 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1879  cold-shock DNA-binding domain protein  58.82 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0985  cold-shock domain-contain protein  56.52 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.693181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  57.14 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0990  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.97 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0731178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>