More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0335 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0359  formate dehydrogenase  95.29 
 
 
403 aa  808    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0335  formate dehydrogenase  100 
 
 
403 aa  842    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4915  formate dehydrogenase  72.66 
 
 
399 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.400234  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2451  formate dehydrogenase  69.29 
 
 
401 aa  585  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1161  formate dehydrogenase  66.84 
 
 
401 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3701  formate dehydrogenase  67.71 
 
 
388 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4617  formate dehydrogenase  65.62 
 
 
386 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3198  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  68.72 
 
 
392 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6021  formate dehydrogenase  63.95 
 
 
386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0478753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7007  formate dehydrogenase  63.95 
 
 
386 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1398  formate dehydrogenase  63.68 
 
 
386 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6431  formate dehydrogenase  63.68 
 
 
386 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5420  formate dehydrogenase  62.63 
 
 
386 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.179096 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33765  formate dehydrogenase-like protein  51.45 
 
 
378 aa  344  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91526  dehydrogenase-like protein  50 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.901315  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03470  formate dehydrogenase, putative  47.46 
 
 
373 aa  333  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06525  Probable formate dehydrogenase (EC 1.2.1.2)(NAD-dependent formate dehydrogenase)(FDH) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q03134]  51.48 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0943631  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0162  formate dehydrogenase  46.24 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0167  formate dehydrogenase  46.24 
 
 
374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.08 
 
 
546 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.98 
 
 
525 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.88 
 
 
529 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.75 
 
 
524 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  34.52 
 
 
332 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2266  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  31.91 
 
 
334 aa  144  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.098436  normal  0.0903762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.97 
 
 
525 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.92 
 
 
531 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1916  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  29.87 
 
 
324 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1084  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.91 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  33.59 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  32.16 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.58 
 
 
532 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  32.16 
 
 
322 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  29.79 
 
 
319 aa  139  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0271  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.52 
 
 
524 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.353808  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.21 
 
 
539 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  34.39 
 
 
357 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0417  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.66 
 
 
534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.458098  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3164  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.56 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.608569  normal  0.589284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.83 
 
 
532 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0263  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.59 
 
 
524 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.03617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  32.28 
 
 
330 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  29.86 
 
 
322 aa  137  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  33.61 
 
 
333 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.71 
 
 
523 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.27 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.25 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  35.06 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  33.6 
 
 
333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.85 
 
 
523 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.36 
 
 
542 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  33.61 
 
 
333 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.93 
 
 
334 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1058  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32.1 
 
 
342 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160451  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  30.26 
 
 
324 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35 
 
 
525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  33.33 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  33.33 
 
 
334 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32.66 
 
 
333 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  34.45 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  32.18 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  33.33 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  31.8 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344419  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0450  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  29.33 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  34.45 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30.51 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  33.89 
 
 
334 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3388  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.95 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.640963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.64 
 
 
528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5903  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  31 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2506  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.18 
 
 
528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000305441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.97 
 
 
332 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  30.65 
 
 
333 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2073  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.13 
 
 
415 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0895  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  31.69 
 
 
326 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.602769 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  29.28 
 
 
529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  31.78 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  30.87 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2032  glycerate dehydrogenase  30.99 
 
 
318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  34.5 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  35.71 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  30.65 
 
 
333 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0128  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.03 
 
 
320 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0232098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1162  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  31.95 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3104  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.19 
 
 
412 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.410415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  30.87 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  31.65 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  34.93 
 
 
334 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  32.03 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  34.66 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  31.27 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4261  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  29.7 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0945  glycerate dehydrogenase  30.74 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1660  glycerate dehydrogenase  32.97 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000530389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  33.48 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.6 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0453  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.03 
 
 
412 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32 
 
 
529 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  28.93 
 
 
541 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7079  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  32.62 
 
 
316 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>