More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0823 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  100 
 
 
339 aa  687    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  53.5 
 
 
315 aa  333  3e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.85 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  50.16 
 
 
319 aa  309  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  47.55 
 
 
322 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  52.78 
 
 
323 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  52.16 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  48 
 
 
327 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  47.22 
 
 
322 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  47.08 
 
 
334 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  48.9 
 
 
317 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  47.78 
 
 
322 aa  293  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.29 
 
 
326 aa  289  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.71 
 
 
327 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.76 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.65 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  48.28 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  48.64 
 
 
327 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.25 
 
 
320 aa  279  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  46.52 
 
 
318 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  45.37 
 
 
324 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.54 
 
 
318 aa  268  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  42.77 
 
 
319 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  46.37 
 
 
322 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  42.2 
 
 
341 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  43.44 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  47.45 
 
 
316 aa  265  7e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  47.83 
 
 
274 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5208  Glyoxylate reductase  46.84 
 
 
309 aa  259  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  41.46 
 
 
340 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.99 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  49.54 
 
 
345 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.44 
 
 
319 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.44 
 
 
319 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.2 
 
 
317 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.2 
 
 
317 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2722  Glyoxylate reductase  42.19 
 
 
322 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  44.51 
 
 
317 aa  249  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.5 
 
 
525 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  48.01 
 
 
321 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.49 
 
 
337 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  42.99 
 
 
325 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  43.73 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1337  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.75 
 
 
323 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.1 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1137  glycerate dehydrogenase  45.51 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.657649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1806  glyoxylate reductase, NADH-dependent  40.43 
 
 
318 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.276672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.77 
 
 
331 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  42.94 
 
 
321 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  42.32 
 
 
332 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  43.12 
 
 
333 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0128  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.85 
 
 
320 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0232098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  48.9 
 
 
324 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  45.82 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1298  glycerate dehydrogenase  45.82 
 
 
323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.952061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.51 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  42.24 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  45.82 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  42.37 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3876  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.51 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  42.64 
 
 
321 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  42.38 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  42.38 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1468  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.2 
 
 
323 aa  238  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  42.38 
 
 
325 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.7 
 
 
328 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1299  glycerate dehydrogenase  45.51 
 
 
323 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  42.04 
 
 
329 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0503  lactate dehydrogenase related enzyme  40.68 
 
 
314 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.84 
 
 
322 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1535  glycerate dehydrogenase  45.51 
 
 
323 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.38 
 
 
527 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  40.87 
 
 
357 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1574  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  45.51 
 
 
323 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  41.93 
 
 
328 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.08 
 
 
321 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.5 
 
 
332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  42.77 
 
 
320 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  41.43 
 
 
339 aa  235  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1775  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.13 
 
 
318 aa  235  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.91 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.03 
 
 
330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  42.02 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  46.86 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  46.86 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.54 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  42.02 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  42.99 
 
 
320 aa  232  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  41.43 
 
 
334 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.43 
 
 
334 aa  232  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  42.99 
 
 
330 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  41.67 
 
 
321 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0692  Gluconate 2-dehydrogenase  48.53 
 
 
324 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108341  normal  0.227497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.81 
 
 
334 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  40.81 
 
 
334 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  40.81 
 
 
334 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.25 
 
 
334 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.31 
 
 
324 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  40.75 
 
 
328 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  44.38 
 
 
321 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>