More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0025 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  100 
 
 
319 aa  645    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.69 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  47.65 
 
 
320 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.28 
 
 
317 aa  305  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.28 
 
 
317 aa  305  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  47.96 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.45 
 
 
320 aa  299  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  43.09 
 
 
317 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1337  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.71 
 
 
323 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1137  glycerate dehydrogenase  46.71 
 
 
323 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.657649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1468  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.39 
 
 
323 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3876  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.08 
 
 
323 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1535  glycerate dehydrogenase  46.39 
 
 
323 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1298  glycerate dehydrogenase  46.39 
 
 
323 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.952061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.2 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1299  glycerate dehydrogenase  46.08 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1574  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.08 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.04 
 
 
327 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.83 
 
 
323 aa  279  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  46.07 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.04 
 
 
323 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.08 
 
 
318 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  41.9 
 
 
319 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  44.05 
 
 
316 aa  268  8e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  42.77 
 
 
339 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.62 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.69 
 
 
329 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  43.49 
 
 
332 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  40.63 
 
 
322 aa  258  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  40.57 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  40.62 
 
 
319 aa  252  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  38.54 
 
 
328 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  39.3 
 
 
328 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  39.12 
 
 
322 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  39.12 
 
 
322 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  42.32 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.56 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  39.56 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  40.82 
 
 
339 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  40.19 
 
 
328 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  38.1 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  37.93 
 
 
357 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0128  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.48 
 
 
320 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0232098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  39.38 
 
 
360 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  38.01 
 
 
334 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  36.16 
 
 
328 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  38.87 
 
 
331 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  36.99 
 
 
327 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  37.97 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.03 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  37.11 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  38.51 
 
 
334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  38.23 
 
 
341 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  39.18 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.81 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  39.68 
 
 
332 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  38.44 
 
 
333 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  38.2 
 
 
340 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  38.97 
 
 
327 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.28 
 
 
334 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  36.59 
 
 
334 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  40.89 
 
 
321 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.22 
 
 
328 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.42 
 
 
326 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.97 
 
 
329 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.31 
 
 
326 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  36.48 
 
 
333 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  36.79 
 
 
333 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.31 
 
 
326 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_002950  PG2171  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  41.26 
 
 
319 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.12 
 
 
333 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  37.9 
 
 
328 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  36.56 
 
 
333 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.96 
 
 
326 aa  223  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  37.14 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.5 
 
 
333 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.88 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.03 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  36.56 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  37.26 
 
 
328 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  36.39 
 
 
329 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.7 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  36.22 
 
 
329 aa  219  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  37.89 
 
 
322 aa  219  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  34.6 
 
 
323 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  34.46 
 
 
331 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.19 
 
 
333 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.8 
 
 
328 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  37.07 
 
 
333 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  34.48 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  36.91 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.83 
 
 
332 aa  215  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000514509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  34.38 
 
 
334 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  34.38 
 
 
334 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  34.07 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  35.31 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.99 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2144  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.42 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>