More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0511 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  100 
 
 
331 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  82.78 
 
 
331 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  78.25 
 
 
334 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  77.95 
 
 
334 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  76.74 
 
 
334 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  76.74 
 
 
334 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  76.74 
 
 
334 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  78.08 
 
 
333 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  75.6 
 
 
332 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  73.7 
 
 
333 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  73.64 
 
 
333 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  73.41 
 
 
333 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  72.21 
 
 
333 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  72.95 
 
 
357 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  72.21 
 
 
333 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  71.73 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  71.9 
 
 
333 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  70.82 
 
 
333 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  70.73 
 
 
334 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  71.04 
 
 
334 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  71.04 
 
 
360 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  71.12 
 
 
333 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  71.3 
 
 
333 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  70.39 
 
 
333 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  68.88 
 
 
328 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  67.57 
 
 
330 aa  457  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000307425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  69.18 
 
 
328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  64.35 
 
 
328 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  64.2 
 
 
328 aa  434  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  62.65 
 
 
328 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  62.92 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  62.96 
 
 
328 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  63.58 
 
 
328 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  62.96 
 
 
328 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  56.44 
 
 
332 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  53.94 
 
 
339 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  57.67 
 
 
332 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.69 
 
 
324 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.21 
 
 
323 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  43.89 
 
 
317 aa  268  8.999999999999999e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.62 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  44.92 
 
 
323 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  45.4 
 
 
319 aa  258  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.9 
 
 
327 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1872  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.06 
 
 
319 aa  255  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.81 
 
 
338 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000916966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  43.52 
 
 
311 aa  248  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.27 
 
 
320 aa  245  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  42.77 
 
 
321 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  41.77 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  42.95 
 
 
327 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  44.73 
 
 
274 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1325  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.68 
 
 
315 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3011  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.55 
 
 
315 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0625  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.06 
 
 
322 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3366  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  44.55 
 
 
315 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  43.83 
 
 
327 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.53 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  37.97 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  43.01 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  42.99 
 
 
324 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3326  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.94 
 
 
316 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.95 
 
 
318 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  42.3 
 
 
341 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2196  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.5 
 
 
316 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00601884  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  41.99 
 
 
340 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.68 
 
 
323 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  40.99 
 
 
319 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  41.36 
 
 
316 aa  227  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  41.12 
 
 
318 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  39.25 
 
 
339 aa  222  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2643  putative glycerate dehydrogenase  42.37 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  40 
 
 
330 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.62 
 
 
326 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.62 
 
 
326 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  45.57 
 
 
345 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.63 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  42.77 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5902  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.85 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0476763  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5114  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.74 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.12 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.94 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.01 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.43 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  39.88 
 
 
329 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1858  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  43.4 
 
 
312 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  40.25 
 
 
348 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.27 
 
 
332 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000514509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.08 
 
 
312 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  37.96 
 
 
320 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000853458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.08 
 
 
313 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275914  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  41.02 
 
 
331 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0476  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.86 
 
 
319 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  38.65 
 
 
322 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  40.06 
 
 
329 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.79 
 
 
319 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  36.79 
 
 
319 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.99 
 
 
328 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  39.75 
 
 
346 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  39.75 
 
 
346 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>