More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0202 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0202  flagellar biosynthesis sigma factor  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0660  flagellar biosynthesis sigma factor  98.27 
 
 
231 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3352  flagellar biosynthesis sigma factor  53.48 
 
 
238 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599421  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0282  flagellar biosynthesis sigma factor  53.04 
 
 
239 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00828678  normal  0.769765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0191  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  52.56 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.915338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0180  RNA polymerase sigma factor for flagellar operon FliA  45.58 
 
 
369 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0233  flagellar biosynthesis sigma factor  45.58 
 
 
236 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3950  flagellar biosynthesis sigma factor  44.04 
 
 
238 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0051  flagellar biosynthesis sigma factor  44.44 
 
 
240 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.900468  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3449  flagellar biosynthesis sigma factor  43.05 
 
 
238 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.444138  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  43.18 
 
 
242 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3633  flagellar biosynthesis sigma factor  44.39 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00869538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0057  flagellar biosynthesis sigma factor  43.52 
 
 
240 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001167  RNA polymerase sigma factor for flagellar operon  40.55 
 
 
242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04951  DNA-directed RNA polymerase sigma subunit/flagellum specific  39.63 
 
 
242 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2934  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  39.21 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.142861  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1390  flagellar biosynthesis sigma factor  36.07 
 
 
253 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1180  RNA polymerase sigma-70 factor  35.27 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27870  motility sigma factor 28  34.84 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.736516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1249  RNA polymerase sigma-70 factor  31.09 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2011  sigma 28 (flagella/sporulation)  31.98 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1558  flagellar biosynthesis sigma factor  36.87 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2939  flagellar biosynthesis sigma factor  37.04 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3840  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3921  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2843  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.540839  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4070  flagellar biosynthesis sigma factor  34.38 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0910892  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1699  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3132  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3702  RNA polymerase sigma 28 (sigma F) factor  33.77 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0322756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3081  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit  32.14 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439211  normal  0.490466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4182  flagellar biosynthesis sigma factor  34.38 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142926  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3419  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1590  flagellar biosynthesis sigma factor  35.48 
 
 
240 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0058  flagellar biosynthesis sigma factor  36.65 
 
 
243 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3166  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
243 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1338  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.57 
 
 
241 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1975  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  35.38 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3667  flagellar biosynthesis sigma factor  35.19 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0670648  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3710  sigma 28 (flagella/sporulation)  34.56 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1563  flagellar biosynthesis sigma factor  35.19 
 
 
246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.074099  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45630  flagellar biosynthesis sigma factor  34.88 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531213  normal  0.225194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2805  flagellar biosynthesis sigma factor  34.72 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.838536  normal  0.135389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1979  motility sigma factor FliA  35.19 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3872  flagellar biosynthesis sigma factor  34.88 
 
 
239 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3437  flagellar biosynthesis sigma factor  35.19 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0675365  normal  0.612127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0743  sigma-70 region 4  35.48 
 
 
248 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4341  flagellar biosynthesis sigma factor  34.72 
 
 
246 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  0.695948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1948  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2280  flagellar biosynthesis sigma factor  35 
 
 
240 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2380  flagellar biosynthesis sigma factor  35 
 
 
240 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1526  flagellar biosynthesis sigma factor  34.72 
 
 
246 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733925  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2509  flagellar biosynthesis sigma factor  35.48 
 
 
239 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1667  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.04 
 
 
242 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3910  flagellar biosynthesis sigma factor  34.88 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2290  flagellar biosynthesis sigma factor  33.33 
 
 
243 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2561  flagellar biosynthesis sigma factor  36.41 
 
 
240 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1898  flagellar biosynthesis sigma factor  36.41 
 
 
240 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0179  flagellar biosynthesis sigma factor  35.29 
 
 
244 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1724  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.56 
 
 
239 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0719948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2021  flagellar biosynthesis sigma factor  34.56 
 
 
239 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1164  flagellar biosynthesis sigma factor  35.02 
 
 
229 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.072114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1287  flagellar biosynthesis sigma factor  35.02 
 
 
229 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.867666  hitchhiker  0.000600244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1260  flagellar biosynthesis sigma factor  34.56 
 
 
239 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3374  flagellar biosynthesis sigma factor  34.84 
 
 
244 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300341  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1313  sigma 28 (flagella/sporulation)  34.09 
 
 
242 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1717  flagellar biosynthesis sigma factor  34.56 
 
 
239 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2960  flagellar biosynthesis sigma factor  34.39 
 
 
244 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  0.239261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2836  flagellar biosynthesis sigma factor  33.33 
 
 
243 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0253  flagellar biosynthesis sigma factor  33.33 
 
 
243 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910548  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2171  flagellar biosynthesis sigma factor  35.02 
 
 
229 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000579574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2118  flagellar biosynthesis sigma factor  35.02 
 
 
229 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000381946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2696  flagellar biosynthesis sigma factor  34.56 
 
 
239 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.099334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0271  flagellar biosynthesis sigma factor  33.33 
 
 
243 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2112  flagellar biosynthesis sigma factor  35.02 
 
 
239 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2156  flagellar biosynthesis sigma factor  34.56 
 
 
239 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  33.03 
 
 
262 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0985  RNA polymerase, sigma 28 subunit  34.08 
 
 
242 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2388  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32.63 
 
 
251 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0747  sigma 28 (flagella/sporulation)  31.49 
 
 
241 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.592046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2027  flagellar biosynthesis sigma factor  34.55 
 
 
240 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.41 
 
 
246 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0134  flagellar biosynthesis sigma factor  32.44 
 
 
244 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0929  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  33.19 
 
 
241 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3428  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.71 
 
 
245 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5619  sigma-70 region 4  34.65 
 
 
238 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0185  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
243 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0429  sigma 28 (flagella/sporulation)  32.75 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0198  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410275  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3800  flagellar biosynthesis sigma factor  31.44 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353237  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02870  flagellar biosynthesis sigma factor  32.86 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000184148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0596  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.41 
 
 
237 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1175  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  33.64 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.216131  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3096  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  31.96 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3030  flagellar biosynthesis sigma factor  31.92 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3823  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.96 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.374768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4416  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.39 
 
 
238 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.197457  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0878  putative RNA polymerase sigma factor  33.18 
 
 
260 aa  118  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0195691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3037  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.93 
 
 
260 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4144  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.31 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>