More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0252 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.95 
 
 
557 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.43 
 
 
557 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.14 
 
 
557 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0222  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  97.89 
 
 
569 aa  1120    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.5 
 
 
557 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  70.5 
 
 
558 aa  825    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  70.92 
 
 
560 aa  858    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.32 
 
 
557 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  56.47 
 
 
553 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.5 
 
 
557 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.32 
 
 
557 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.34 
 
 
558 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0252  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  100 
 
 
569 aa  1182    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.42 
 
 
557 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.25 
 
 
557 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.25 
 
 
557 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.69 
 
 
557 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.62 
 
 
557 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.32 
 
 
557 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.25 
 
 
557 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.45 
 
 
555 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.22 
 
 
563 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.11 
 
 
566 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  54.17 
 
 
561 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  54.17 
 
 
583 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.17 
 
 
561 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  54.17 
 
 
561 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.17 
 
 
561 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  55.45 
 
 
569 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.08 
 
 
573 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.17 
 
 
561 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.17 
 
 
561 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.5 
 
 
563 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.17 
 
 
583 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.99 
 
 
561 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  54.53 
 
 
550 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  52.34 
 
 
569 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.73 
 
 
572 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  53.82 
 
 
549 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  53.69 
 
 
567 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  54.17 
 
 
552 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  51.9 
 
 
569 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  51.99 
 
 
553 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.63 
 
 
572 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.35 
 
 
561 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  52.7 
 
 
586 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  52.52 
 
 
584 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  52.7 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.97 
 
 
560 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  52.7 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  52.52 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  52.7 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.25 
 
 
572 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1189  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.82 
 
 
551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  52.16 
 
 
584 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.35 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.35 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.35 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.35 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  52.88 
 
 
599 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.55 
 
 
562 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.55 
 
 
562 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  51.06 
 
 
579 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.55 
 
 
577 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  53.5 
 
 
556 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  50.97 
 
 
572 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.22 
 
 
569 aa  598  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  51.72 
 
 
567 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.52 
 
 
560 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  50.88 
 
 
579 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.17 
 
 
560 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.15 
 
 
569 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.8 
 
 
569 aa  595  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.18 
 
 
565 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.81 
 
 
557 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.63 
 
 
557 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.98 
 
 
565 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.91 
 
 
554 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.98 
 
 
565 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.8 
 
 
565 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  51.62 
 
 
601 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.45 
 
 
557 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.72 
 
 
581 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.27 
 
 
557 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.17 
 
 
565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.72 
 
 
562 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  51.27 
 
 
564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  51.08 
 
 
604 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.63 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.45 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.63 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 
581 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.72 
 
 
561 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.89 
 
 
560 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.45 
 
 
562 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.46 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>