104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5075 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5075  2-oxopropyl-CoM reductase (carboxylating)  100 
 
 
130 aa  271  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0256986  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4867  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  66.09 
 
 
523 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0742822 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5048  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  66.09 
 
 
523 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4827  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.67 
 
 
539 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.71 
 
 
467 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 
480 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 
480 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.11 
 
 
472 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.18 
 
 
474 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.83 
 
 
450 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 
591 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.78 
 
 
605 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2645  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.17 
 
 
474 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.666517  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36951  FAD flavoprotein  31.46 
 
 
477 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 
468 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  34.69 
 
 
461 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.36 
 
 
474 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
474 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.73 
 
 
594 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
475 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
603 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
603 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
607 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.11 
 
 
626 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.44 
 
 
476 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  26.67 
 
 
470 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
474 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 
476 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
475 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.07 
 
 
467 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
478 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  29.73 
 
 
504 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.07 
 
 
467 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
478 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 
474 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 
474 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
474 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  30.84 
 
 
584 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2925  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
474 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
475 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.42 
 
 
478 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
474 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
496 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
602 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  25 
 
 
478 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.62 
 
 
476 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.42 
 
 
478 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.42 
 
 
478 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 
481 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.2 
 
 
478 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.42 
 
 
579 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  25.47 
 
 
478 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0104  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.44 
 
 
483 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
475 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
476 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.93 
 
 
593 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00163952  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
495 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.13 
 
 
459 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
475 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
474 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
495 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.47 
 
 
478 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.55 
 
 
476 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.04 
 
 
594 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.47 
 
 
478 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.55 
 
 
477 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.1 
 
 
585 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  31.78 
 
 
462 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
476 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.47 
 
 
478 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.47 
 
 
478 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
479 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>