More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36951 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_36951  FAD flavoprotein  100 
 
 		 477 aa  967    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  67.3 
 
 		 511 aa  645    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  56.13 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.13 
 
 		 581 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.22 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.7 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.91 
 
 		 467 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.39 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.7 
 
 		 467 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.45 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.08 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.72 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.79 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.29 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.35 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.6 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  55.26 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  55 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.86 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.24 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.65 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.46 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  53 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.51 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.89 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.58 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.36 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.58 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.93 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.93 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.22 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.9 
 
 		 466 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.58 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  53 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.07 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.79 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.93 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.94 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  52.68 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.39 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.78 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.85 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.5 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.42 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.64 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.72 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.22 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.14 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  52.16 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  49.89 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.3 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.28 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.36 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.5 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.17 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.65 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.73 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.56 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  48.39 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.18 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.78 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.62 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.39 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.61 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 		 475 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.39 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.61 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.61 
 
 		 478 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.02 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.64 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.38 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.54 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.65 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.54 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.38 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.57 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.17 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.39 
 
 		 474 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.17 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>