More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4827 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4827  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 539 aa  1118    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5048  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.84 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4867  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.46 
 
 		 523 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0742822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.56 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 		 484 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.19 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.61 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.45 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.41 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.28 
 
 		 745 aa  156  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  28.42 
 
 		 466 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  29 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.84 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  28.78 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.48 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  28.69 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  29.89 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  28.97 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.05 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  27.6 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  28.57 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.11 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.23 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  29.59 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  27.87 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 464 aa  146  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.82 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.47 
 
 		 476 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.83 
 
 		 598 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.88 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.36 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.87 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.71 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.25 
 
 		 465 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  30.85 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.38 
 
 		 593 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.36 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.47 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.5 
 
 		 625 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  27 
 
 		 476 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 		 465 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  28.51 
 
 		 548 aa  143  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.14 
 
 		 476 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  29.16 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.92 
 
 		 467 aa  143  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  26.36 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.79 
 
 		 619 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.92 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.68 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.68 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  28.19 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.68 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.68 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  30.02 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  26.95 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.5 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  28.66 
 
 		 767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  26.68 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.61 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  26.56 
 
 		 546 aa  141  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.78 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.46 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.97 
 
 		 476 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.99 
 
 		 593 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.76 
 
 		 474 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  27.55 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.46 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  27.33 
 
 		 451 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 		 599 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.61 
 
 		 476 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.61 
 
 		 476 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  27.98 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  28.94 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  24.64 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.38 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  28.28 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.51 
 
 		 467 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.95 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  28.51 
 
 		 767 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  27 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  27.86 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  27.84 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.24 
 
 		 476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  27.85 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  28.38 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  27.46 
 
 		 519 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.84 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  28.98 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>