More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2329 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
448 aa  906    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.9 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.79 
 
 
442 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0635526  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2635  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.82 
 
 
430 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1355  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.297533  decreased coverage  0.00000000605303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
593 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.29 
 
 
482 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.38 
 
 
454 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.28 
 
 
473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.9 
 
 
451 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 
450 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.21 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  32.05 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.49 
 
 
473 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.49 
 
 
562 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.53 
 
 
467 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
593 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  28.96 
 
 
585 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 
460 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
562 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
563 aa  160  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  30.73 
 
 
584 aa  160  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  30.7 
 
 
466 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.35 
 
 
458 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.6 
 
 
466 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
680 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
484 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
619 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
599 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
459 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.89 
 
 
455 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.56 
 
 
465 aa  155  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 
468 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.82 
 
 
459 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.69 
 
 
625 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.9 
 
 
585 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 
470 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.19 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.18 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.64 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.11 
 
 
448 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.07 
 
 
474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 
476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  29.28 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.69 
 
 
470 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.25 
 
 
478 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.5 
 
 
481 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.07 
 
 
459 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0825  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
446 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0472213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.49 
 
 
480 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 
716 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 
467 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 
459 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.95 
 
 
484 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
468 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
470 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
468 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 
459 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 
479 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 
474 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.15 
 
 
472 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 
475 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03462  dihydrolipoamide dehydrogenase  29 
 
 
476 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.19 
 
 
452 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.14 
 
 
472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.37 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  29.29 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.04 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 
468 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2747  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.46 
 
 
469 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002552  dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase complex  28.73 
 
 
475 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.02 
 
 
459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.16 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 
459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.05 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.31 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.94 
 
 
475 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.59 
 
 
475 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
475 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  28.32 
 
 
446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 
475 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
473 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 
474 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.86 
 
 
462 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>