More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0490 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
439 aa  864    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.9 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.74 
 
 
442 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0635526  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1355  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.05 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.297533  decreased coverage  0.00000000605303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2635  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.15 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  33.78 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.91 
 
 
458 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
562 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 
562 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 
563 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.08 
 
 
478 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.46 
 
 
461 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 
465 aa  159  8e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.82 
 
 
458 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.5 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.49 
 
 
470 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.49 
 
 
470 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.49 
 
 
470 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.31 
 
 
484 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
484 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.72 
 
 
585 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
466 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
470 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
470 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
470 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
470 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
470 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.31 
 
 
484 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
470 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.45 
 
 
452 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  29.29 
 
 
584 aa  149  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.03 
 
 
455 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
467 aa  149  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 
461 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
474 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
481 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.19 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 
459 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.35 
 
 
457 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.66 
 
 
470 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 
474 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.19 
 
 
453 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  30.45 
 
 
452 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  29.77 
 
 
448 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.07 
 
 
468 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.79 
 
 
459 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 
474 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
474 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.75 
 
 
448 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
474 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  28 
 
 
459 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.41 
 
 
470 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 
475 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 
474 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 
474 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
475 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  28.54 
 
 
452 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  32.37 
 
 
467 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
474 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
474 aa  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.96 
 
 
463 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
474 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.56 
 
 
460 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.07 
 
 
459 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  29 
 
 
474 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  28.47 
 
 
585 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.05 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.36 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4827  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.06 
 
 
539 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  29.1 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.66 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002552  dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase complex  28.29 
 
 
475 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.92 
 
 
474 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  29.56 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  29.29 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 
454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.79 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5048  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.78 
 
 
523 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.82 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.63 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  29.93 
 
 
451 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.12 
 
 
463 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  30.05 
 
 
452 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4867  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.57 
 
 
523 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0742822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.78 
 
 
450 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2747  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.64 
 
 
469 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>