More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
467 aa  933    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  78.42 
 
 
467 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  69.46 
 
 
468 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  68.52 
 
 
467 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  68.74 
 
 
470 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  68.74 
 
 
470 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  67.95 
 
 
467 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  68.52 
 
 
470 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  68.01 
 
 
495 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  67.58 
 
 
471 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  64.81 
 
 
470 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  64.38 
 
 
467 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  66.67 
 
 
471 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  66.45 
 
 
467 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.16 
 
 
464 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.58 
 
 
460 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  62.85 
 
 
463 aa  549  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  63.68 
 
 
460 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.59 
 
 
481 aa  545  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  62.72 
 
 
463 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  59.45 
 
 
479 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  57.78 
 
 
493 aa  529  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  63.79 
 
 
463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  58.89 
 
 
465 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  60.09 
 
 
491 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  58.56 
 
 
483 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  56.62 
 
 
471 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  56.41 
 
 
478 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  55.13 
 
 
476 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.8 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  53.81 
 
 
468 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  58.21 
 
 
495 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  54.13 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 
491 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  59.57 
 
 
480 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  53.4 
 
 
478 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
458 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
458 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
470 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 
468 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
471 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
465 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
459 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
470 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
465 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 
468 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
616 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 
467 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 
465 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.26 
 
 
474 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  32.4 
 
 
462 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.68 
 
 
459 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.32 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
459 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
484 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.46 
 
 
459 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
459 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
484 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.54 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 
468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
463 aa  216  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
461 aa  216  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.68 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.43 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
470 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
470 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
470 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.97 
 
 
473 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
471 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
470 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.65 
 
 
469 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
470 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 
470 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
480 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 
480 aa  210  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  26.95 
 
 
463 aa  210  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
470 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
462 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 
473 aa  209  7e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 
465 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>