More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6404 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  71.03 
 
 		 470 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  78.42 
 
 		 467 aa  729    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  72.59 
 
 		 467 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  71.24 
 
 		 470 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  69.96 
 
 		 467 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  71.24 
 
 		 470 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 		 467 aa  926    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  68.32 
 
 		 468 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  69.36 
 
 		 495 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  68.72 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  63.95 
 
 		 470 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  63.87 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  65.74 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  66.45 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  62.93 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.47 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.51 
 
 		 481 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  61.28 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.47 
 
 		 464 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 		 460 aa  534  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  59.19 
 
 		 479 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  59.23 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  56.88 
 
 		 493 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  60 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  58.47 
 
 		 483 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  62.99 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  55.25 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  56.53 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  55.77 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  55.99 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  57.93 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 		 491 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.84 
 
 		 506 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.17 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  53.4 
 
 		 468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  54.84 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 458 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.39 
 
 		 468 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.18 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.61 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 		 470 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.08 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.14 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 459 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.32 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 		 465 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.19 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 		 616 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.68 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.35 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 		 473 aa  219  7e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 470 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.61 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.18 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.39 
 
 		 459 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 		 462 aa  216  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>