More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0782 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  95.93 
 
 
467 aa  899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
470 aa  938    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  69.83 
 
 
463 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  64.81 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  63.95 
 
 
467 aa  574  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 
468 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  61.83 
 
 
470 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  61.57 
 
 
495 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  61.28 
 
 
471 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  61.83 
 
 
470 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  61.83 
 
 
470 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  62.34 
 
 
481 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  61.51 
 
 
467 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.89 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  61.49 
 
 
471 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.45 
 
 
467 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  61.27 
 
 
463 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  64.58 
 
 
467 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  58.94 
 
 
493 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  60.13 
 
 
479 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  60.93 
 
 
460 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  61.23 
 
 
460 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  61.45 
 
 
491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  61.04 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  62.72 
 
 
463 aa  512  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  60.22 
 
 
465 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  56.51 
 
 
491 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  56.95 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  55.46 
 
 
471 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  58.33 
 
 
495 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  55.3 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.82 
 
 
480 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  54.82 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.65 
 
 
506 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  53.81 
 
 
468 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  56.28 
 
 
478 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
468 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
465 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 
474 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 
458 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.99 
 
 
465 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 
465 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 
471 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.78 
 
 
468 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.8 
 
 
459 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
470 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.23 
 
 
470 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 
480 aa  220  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
459 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.2 
 
 
480 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
467 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
466 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
459 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.95 
 
 
562 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 
459 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.86 
 
 
491 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.52 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.13 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.13 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.49 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
492 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.08 
 
 
459 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.98 
 
 
585 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.38 
 
 
471 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.14 
 
 
459 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
466 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.32 
 
 
459 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 
470 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.05 
 
 
470 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.67 
 
 
471 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 
482 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.1 
 
 
462 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 
465 aa  208  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.23 
 
 
463 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 
463 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
459 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.88 
 
 
479 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
478 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
470 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.17 
 
 
467 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 
459 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
473 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 
468 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
479 aa  206  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>