More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0689 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.96 
 
 		 464 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 		 463 aa  920    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  72.29 
 
 		 460 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  72.15 
 
 		 460 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  69.08 
 
 		 481 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  64.5 
 
 		 479 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  63.02 
 
 		 493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  62.98 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  64.56 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  61.28 
 
 		 470 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  62.85 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  61.28 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  63.32 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  61.28 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  65.24 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  61.69 
 
 		 491 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.92 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.64 
 
 		 467 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  61.19 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  61.19 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  61.14 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  61.19 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  59.49 
 
 		 463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  61.07 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  60.09 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  60.25 
 
 		 495 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  59.83 
 
 		 471 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  59.41 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  57.66 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.17 
 
 		 467 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  57.92 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  59.83 
 
 		 495 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  56 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.23 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.64 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  57.92 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.45 
 
 		 459 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.21 
 
 		 467 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 480 aa  249  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 		 471 aa  249  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  34.42 
 
 		 462 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 		 465 aa  242  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 480 aa  242  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 470 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.86 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.19 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 		 472 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.67 
 
 		 466 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 479 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 		 477 aa  232  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.67 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.57 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.34 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.27 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 		 562 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.77 
 
 		 473 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  31.58 
 
 		 464 aa  229  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.42 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 		 473 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.42 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 		 585 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 		 481 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>