More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0230 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 454 aa  915    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.28 
 
 		 449 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0546  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.06 
 
 		 449 aa  610  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.614447  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.67 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0825  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 446 aa  532  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0472213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 		 562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.78 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.44 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.23 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 		 459 aa  317  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 459 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.61 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 		 465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.97 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 		 462 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 		 463 aa  309  8e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 		 463 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.24 
 
 		 473 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.3 
 
 		 459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.85 
 
 		 469 aa  302  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.26 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.02 
 
 		 473 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.02 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 462 aa  300  4e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 479 aa  300  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.66 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.99 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.1 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.66 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.64 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 470 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 		 464 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 		 467 aa  296  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 		 468 aa  295  8e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  38.84 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 468 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 		 466 aa  292  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.09 
 
 		 468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  37.96 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 		 479 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 		 465 aa  289  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.15 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.3 
 
 		 465 aa  289  7e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.73 
 
 		 474 aa  289  9e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.02 
 
 		 478 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.95 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.09 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 		 539 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.99 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.15 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.07 
 
 		 465 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 		 487 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.22 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>