More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4867 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5048  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  99.04 
 
 
523 aa  1076    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4867  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
523 aa  1083    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0742822 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4827  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.46 
 
 
539 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.48 
 
 
546 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5075  2-oxopropyl-CoM reductase (carboxylating)  66.09 
 
 
130 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0256986  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  28.77 
 
 
466 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.79 
 
 
584 aa  143  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.57 
 
 
439 aa  140  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.48 
 
 
463 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  27.54 
 
 
546 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  27.55 
 
 
451 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  26.86 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.57 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  26.65 
 
 
546 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  27.08 
 
 
452 aa  133  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.07 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.95 
 
 
563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.17 
 
 
585 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  27.29 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.95 
 
 
562 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  27.46 
 
 
745 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.49 
 
 
478 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  26.72 
 
 
452 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  27.51 
 
 
452 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.31 
 
 
478 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  27.16 
 
 
452 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.16 
 
 
451 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.07 
 
 
478 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.21 
 
 
475 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.07 
 
 
478 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  25.05 
 
 
478 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.73 
 
 
478 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  26.38 
 
 
479 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.26 
 
 
478 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  26.13 
 
 
452 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  26.62 
 
 
451 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.76 
 
 
458 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.01 
 
 
463 aa  123  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.31 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  26.48 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  27.45 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.41 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 
468 aa  121  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.74 
 
 
454 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.53 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  28.39 
 
 
452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  25.62 
 
 
767 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.93 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  26.68 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.48 
 
 
479 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.53 
 
 
467 aa  120  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  26.25 
 
 
450 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  25.62 
 
 
550 aa  120  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  26.25 
 
 
450 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.17 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  26.27 
 
 
451 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.65 
 
 
478 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.65 
 
 
478 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  25.81 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.2 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.59 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  25.76 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.96 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.22 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  26.9 
 
 
452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.32 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  25.76 
 
 
451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.44 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.99 
 
 
602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.22 
 
 
481 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.62 
 
 
468 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.36 
 
 
607 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  25.39 
 
 
461 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  27.57 
 
 
454 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  23.71 
 
 
602 aa  117  6e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.38 
 
 
478 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.89 
 
 
462 aa  116  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.51 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  27.23 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  22.94 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.11 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.05 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.11 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.89 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.58 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.62 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.37 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.73 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.11 
 
 
468 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.78 
 
 
464 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.72 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>