More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3535 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  98 
 
 		 451 aa  900    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  98 
 
 		 451 aa  901    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  78.35 
 
 		 452 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  78.92 
 
 		 466 aa  740    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  78.79 
 
 		 452 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  82.81 
 
 		 452 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  81.03 
 
 		 452 aa  756    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  100 
 
 		 451 aa  915    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  80.49 
 
 		 451 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  96.01 
 
 		 451 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  81.15 
 
 		 451 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  79.19 
 
 		 452 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  60.94 
 
 		 453 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  58.74 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  58.44 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  57.85 
 
 		 459 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  57.87 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  57.08 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  56.15 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.25 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.08 
 
 		 457 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  53.1 
 
 		 459 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  54.57 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.16 
 
 		 452 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  54.81 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  55.26 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  54.12 
 
 		 452 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  53.69 
 
 		 451 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  53.91 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  53.91 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  53.47 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  53.52 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  53.24 
 
 		 451 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  53.36 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  52.76 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  52.47 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  51.93 
 
 		 519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  53.24 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  51.43 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  51.88 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  53.67 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.41 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  51.55 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  52.55 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  51 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  50.11 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  52.34 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  50.78 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  51.11 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  53.59 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  51.22 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  50.44 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  50 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  50.11 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  51 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0978  glutathione reductase  50.11 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  49.89 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  49.89 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.67 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.66 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  47.83 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  51.88 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2094  glutathione reductase  49.89 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1461  glutathione reductase  51.79 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  48.2 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  47.37 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.44 
 
 		 466 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.89 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  48.57 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  51.21 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1571  glutathione reductase  50.89 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483199  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  47.33 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  48.12 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  50.45 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  47.12 
 
 		 450 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  47.9 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  50.22 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  45.45 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  47.11 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  47.66 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  46.34 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  46.12 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  45.68 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  45.01 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0604  glutathione reductase  47.54 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.633864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  46.34 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  45.23 
 
 		 451 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  45.23 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  45.23 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  45.68 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  45.23 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  46.41 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  45.45 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>