More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2811 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2811  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
203 aa  413  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  76.73 
 
 
202 aa  334  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  74.75 
 
 
202 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  74.26 
 
 
202 aa  325  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  71.92 
 
 
203 aa  311  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1495  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  68.32 
 
 
202 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3254  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  65.5 
 
 
203 aa  291  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.846345  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3508  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  68.84 
 
 
203 aa  288  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  65.31 
 
 
200 aa  279  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
200 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
200 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
200 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  62.24 
 
 
200 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
200 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  63.78 
 
 
200 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1426  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.32 
 
 
204 aa  269  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  62.96 
 
 
200 aa  266  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  63.27 
 
 
200 aa  266  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  63.49 
 
 
200 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  62.96 
 
 
200 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  62.24 
 
 
200 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0823  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.02 
 
 
199 aa  264  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  62.24 
 
 
200 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1049  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.02 
 
 
199 aa  261  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  60.85 
 
 
199 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  61.22 
 
 
200 aa  259  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  59.69 
 
 
199 aa  258  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  59.9 
 
 
201 aa  257  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1405  NADH dehydrogenase (quinone)  61.22 
 
 
203 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  60.41 
 
 
200 aa  248  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.79 
 
 
199 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  58.38 
 
 
201 aa  239  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  54.69 
 
 
197 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  59.36 
 
 
202 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  54.23 
 
 
205 aa  225  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.36 
 
 
202 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0988  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.88 
 
 
239 aa  220  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1968  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.88 
 
 
247 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.029611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0710  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.08 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1763  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.41 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2834  NADH dehydrogenase I chain C  48.84 
 
 
227 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2563  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.45 
 
 
231 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2703  NADH dehydrogenase I chain C  47.91 
 
 
227 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0819  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.83 
 
 
223 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01289  NADH dehydrogenase subunit C  45.96 
 
 
250 aa  188  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169426  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  45.07 
 
 
227 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  45.07 
 
 
227 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1962  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.55 
 
 
244 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000519419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.28 
 
 
215 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2829  NADH dehydrogenase subunit C  43.75 
 
 
249 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.448263  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0242  NADH dehydrogenase subunit C  44.44 
 
 
228 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0271  NADH dehydrogenase subunit C  44.93 
 
 
227 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.15 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.33 
 
 
215 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.13 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  48.55 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.13 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.75 
 
 
209 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.13 
 
 
212 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.55 
 
 
219 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  49.71 
 
 
208 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  48.28 
 
 
199 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  49.13 
 
 
202 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  48.35 
 
 
214 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  49.13 
 
 
202 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  45.98 
 
 
200 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  47.4 
 
 
202 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  44.44 
 
 
284 aa  158  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  48.55 
 
 
200 aa  158  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.3 
 
 
204 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  43.85 
 
 
213 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  50.32 
 
 
207 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  48.81 
 
 
205 aa  155  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  47.13 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  46.63 
 
 
200 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  48.72 
 
 
215 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  44.32 
 
 
204 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  45.4 
 
 
200 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.21 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  45.14 
 
 
200 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.63 
 
 
213 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  43.75 
 
 
204 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.86 
 
 
309 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  43.53 
 
 
204 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.68 
 
 
205 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  47.44 
 
 
201 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  40 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  42.13 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  43.26 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.73 
 
 
213 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  41.18 
 
 
290 aa  142  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  46.11 
 
 
200 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  46.11 
 
 
200 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>