More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1557 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  63.18 
 
 
200 aa  264  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.08 
 
 
209 aa  259  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  63.37 
 
 
200 aa  260  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60 
 
 
215 aa  255  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  61.58 
 
 
202 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  61.58 
 
 
202 aa  252  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.11 
 
 
215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  58.71 
 
 
215 aa  251  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  60.59 
 
 
202 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.3 
 
 
219 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  59.7 
 
 
200 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.79 
 
 
219 aa  248  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.5 
 
 
219 aa  248  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  59.5 
 
 
200 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  56.65 
 
 
215 aa  245  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  58.5 
 
 
201 aa  244  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  58.21 
 
 
201 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  56.72 
 
 
200 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  56.22 
 
 
200 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  54.63 
 
 
205 aa  237  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  57.56 
 
 
214 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  55.67 
 
 
204 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  53.69 
 
 
212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  55.72 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  56.22 
 
 
206 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  56.44 
 
 
200 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  56.44 
 
 
200 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  53.96 
 
 
205 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  55.84 
 
 
199 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60.67 
 
 
274 aa  226  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  55.45 
 
 
200 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  56.06 
 
 
201 aa  225  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  53.66 
 
 
207 aa  225  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  54.5 
 
 
204 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  55.5 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  57.92 
 
 
284 aa  224  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  54 
 
 
204 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  54 
 
 
204 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  55.44 
 
 
217 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_002978  WD1122  NADH dehydrogenase I, C subunit  65.1 
 
 
190 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  54.69 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.8 
 
 
309 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  49.22 
 
 
281 aa  210  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  47.98 
 
 
290 aa  206  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0788  NADH dehydrogenase I, C subunit  48.15 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  54.6 
 
 
192 aa  198  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.282798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  51.89 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0432  NADH dehydrogenase I, C subunit  57.05 
 
 
186 aa  178  5.999999999999999e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50 
 
 
202 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  50 
 
 
202 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  47.78 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.33 
 
 
187 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  46.59 
 
 
200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1495  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.43 
 
 
202 aa  161  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1049  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.73 
 
 
199 aa  161  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  47.22 
 
 
200 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  48.59 
 
 
199 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
200 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  46.59 
 
 
200 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0823  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.07 
 
 
199 aa  158  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  47.46 
 
 
199 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.11 
 
 
202 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.07 
 
 
202 aa  157  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.07 
 
 
202 aa  157  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
200 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2811  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.85 
 
 
203 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
200 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3254  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.76 
 
 
203 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.846345  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
200 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 
200 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  46.11 
 
 
200 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  46.02 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  44.94 
 
 
200 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.61 
 
 
197 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  44.13 
 
 
200 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.69 
 
 
199 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  45.56 
 
 
200 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3508  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.82 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  42.13 
 
 
200 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  44.07 
 
 
200 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  43.65 
 
 
205 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  42.42 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  42.42 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1405  NADH dehydrogenase (quinone)  42.77 
 
 
203 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1426  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.07 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.15 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  40.91 
 
 
201 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  43.39 
 
 
201 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2834  NADH dehydrogenase I chain C  41.36 
 
 
227 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2563  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0819  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.35 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180936  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2703  NADH dehydrogenase I chain C  40.31 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1968  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.05 
 
 
247 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.029611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>