More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0890 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  80.5 
 
 
200 aa  345  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  80.5 
 
 
200 aa  343  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  73.23 
 
 
200 aa  319  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  72.22 
 
 
202 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  73.74 
 
 
202 aa  303  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  73.74 
 
 
202 aa  303  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  69.65 
 
 
209 aa  294  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  68.5 
 
 
200 aa  293  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  68.18 
 
 
215 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
205 aa  286  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  67.5 
 
 
205 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  65.99 
 
 
215 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  65.5 
 
 
200 aa  281  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.16 
 
 
219 aa  279  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.84 
 
 
215 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  64.82 
 
 
200 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  65.15 
 
 
219 aa  273  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  65.15 
 
 
219 aa  274  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  60.5 
 
 
200 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  60.5 
 
 
200 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.5 
 
 
204 aa  266  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.86 
 
 
212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  59.7 
 
 
215 aa  265  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  62.69 
 
 
199 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  58.5 
 
 
200 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
204 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  61.86 
 
 
206 aa  261  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  59.41 
 
 
207 aa  256  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  62.76 
 
 
208 aa  256  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  58.71 
 
 
201 aa  255  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  60.7 
 
 
204 aa  254  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  60.41 
 
 
204 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  58.76 
 
 
206 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  61.81 
 
 
214 aa  247  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  58.25 
 
 
201 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  58.21 
 
 
213 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.99 
 
 
274 aa  234  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.02 
 
 
309 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60.56 
 
 
213 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  55.38 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  53.03 
 
 
284 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  58.24 
 
 
213 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  51.89 
 
 
281 aa  201  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.73 
 
 
192 aa  197  7e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.282798  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0788  NADH dehydrogenase I, C subunit  47.85 
 
 
192 aa  192  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  50 
 
 
290 aa  192  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_002978  WD1122  NADH dehydrogenase I, C subunit  48.09 
 
 
190 aa  187  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.28 
 
 
202 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  50.28 
 
 
202 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0432  NADH dehydrogenase I, C subunit  52.47 
 
 
186 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  47.51 
 
 
200 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.28 
 
 
199 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  47.51 
 
 
200 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0819  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.98 
 
 
223 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  49.17 
 
 
200 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1049  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.72 
 
 
199 aa  167  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  46.96 
 
 
200 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0823  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.62 
 
 
199 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.85 
 
 
187 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  48.07 
 
 
200 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
201 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  46.96 
 
 
200 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1495  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.9 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  46.49 
 
 
205 aa  165  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  48.62 
 
 
200 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  47.51 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3254  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.16 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.846345  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0988  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.93 
 
 
239 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  46.96 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  47.51 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  47.51 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  47.51 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.29 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3508  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.43 
 
 
203 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2703  NADH dehydrogenase I chain C  43.15 
 
 
227 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  46.96 
 
 
200 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2834  NADH dehydrogenase I chain C  43.37 
 
 
227 aa  158  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  46.96 
 
 
200 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1405  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
203 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  46.89 
 
 
199 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.28 
 
 
203 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.55 
 
 
202 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.55 
 
 
202 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  46.89 
 
 
199 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2811  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.13 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.18 
 
 
197 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  45.74 
 
 
227 aa  151  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  45.74 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2563  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
231 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  42.54 
 
 
201 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1426  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.94 
 
 
204 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>