276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0828 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0828  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 		 70 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1095  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  51.56 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2054  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  50 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  44.44 
 
 		 1204 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3800  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.32 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0529751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3743  biotin/lipoyl attachment protein  40.32 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.325325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3884  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.32 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4187  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.63 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3861  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.3 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3423  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.76 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.991977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  42.42 
 
 		 1226 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  43.94 
 
 		 1488 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  45.9 
 
 		 1206 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  43.33 
 
 		 1201 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1576  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.94 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  43.28 
 
 		 1210 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  48.15 
 
 		 607 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  48.15 
 
 		 607 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  48.15 
 
 		 606 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  48.15 
 
 		 607 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  45 
 
 		 601 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  50 
 
 		 594 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  42.86 
 
 		 613 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  51.85 
 
 		 603 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  46.3 
 
 		 599 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  47.17 
 
 		 1154 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  40.91 
 
 		 1231 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  41.18 
 
 		 600 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  48.15 
 
 		 593 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  40.68 
 
 		 1158 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  46.3 
 
 		 596 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.407057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  41.27 
 
 		 1203 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  42.86 
 
 		 569 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  39.66 
 
 		 569 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3702  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.79 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  46.55 
 
 		 602 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  45.16 
 
 		 1233 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  43.86 
 
 		 1179 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  39.66 
 
 		 569 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  44.83 
 
 		 604 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0555  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.51 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  37.68 
 
 		 1157 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19240  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.28 
 
 		 591 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0845  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  40 
 
 		 595 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  40.3 
 
 		 592 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  37.1 
 
 		 610 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4108  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.44 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.888479  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  43.86 
 
 		 1179 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2807  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  40.62 
 
 		 652 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.167198  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  47.06 
 
 		 1165 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  45.28 
 
 		 1154 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  44.44 
 
 		 608 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0049  biotin/lipoyl attachment  40.32 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0152138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  44.44 
 
 		 611 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  42.42 
 
 		 1208 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1155  biotin/lipoyl attachment  36.76 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.849643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  44.44 
 
 		 611 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  44.44 
 
 		 611 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  40.68 
 
 		 595 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1012  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  41.67 
 
 		 600 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.412146  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0815  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  34.33 
 
 		 652 aa  47.4  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  40.68 
 
 		 1090 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  40.38 
 
 		 568 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.38 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  47.17 
 
 		 605 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0337  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8317  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  41.79 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  42.11 
 
 		 1212 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0569  biotin carboxyl carrier protein  42.59 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0549  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.43 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1839  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  43.55 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  36.51 
 
 		 1209 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2442  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  43.55 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  35.48 
 
 		 599 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  40.82 
 
 		 1197 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  40.62 
 
 		 603 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6512  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  38.81 
 
 		 621 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0609774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  42.59 
 
 		 597 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  40.62 
 
 		 602 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  42.11 
 
 		 1153 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  37.93 
 
 		 594 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  43.4 
 
 		 1144 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  42.62 
 
 		 595 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0952  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.38 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 1200 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  41.38 
 
 		 1209 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  35.48 
 
 		 599 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  38.71 
 
 		 1184 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3468  Dihydrolipoyllysine-residue(2-methylpropanoyl) transferase  38.71 
 
 		 406 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636504  normal  0.041533 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  42.86 
 
 		 1033 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1271  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  38.81 
 
 		 617 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4768  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  37.29 
 
 		 674 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  35.48 
 
 		 599 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0254  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  46.3 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0511  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  39.22 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06960  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  46.55 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2917  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.28 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.332862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  36.84 
 
 		 1147 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3521  biotin carboxyl carrier protein  37.25 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  40.68 
 
 		 592 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>