More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2009 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2009  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.406891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  29.28 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.52 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  26.73 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  28.34 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  29.11 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  27.67 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.38 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  27.75 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.7 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  28.64 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.27 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  29.11 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  27.7 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  28.64 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.2 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  28.17 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  29.03 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  28.64 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  28.64 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  28.64 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  26.23 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  29.47 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  32.8 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1946  transcriptional regulatory protein PhoP  27.32 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  23.19 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  27.7 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  26.44 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.7 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.88 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1388  transcriptional regulatory protein PhoP  27.94 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2255  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  26.26 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  26.26 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4140  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.34 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2494  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.178511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4344  two component transcriptional regulator  26.34 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000925591  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1873  response regulator receiver  25.27 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  26.76 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2614  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1850  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.32 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0826767  hitchhiker  0.000859255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2501  two component transcriptional regulator  27.32 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1724  two component transcriptional regulator  27.8 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  25.11 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  23.63 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4212  two component transcriptional regulator  26.34 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000202187  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.13 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  24.53 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.42 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  28.88 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.01 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0589  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.19 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.48 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  27.44 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  34.92 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  34.92 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  34.92 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.62 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  34.92 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  27.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  34.92 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  26.05 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>