36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1600 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 555 aa  1128    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  65.21 
 
 		 573 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  69.93 
 
 		 561 aa  715    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  62.98 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  55.2 
 
 		 1540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  47.49 
 
 		 560 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.14 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.4 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.64 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  33.46 
 
 		 550 aa  207  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  27.24 
 
 		 556 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.63 
 
 		 533 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  32.68 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.6 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.07 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.27 
 
 		 573 aa  104  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.13 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.39 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.84 
 
 		 525 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.28 
 
 		 517 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  27.2 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.7 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.84 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.57 
 
 		 507 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.8 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.64 
 
 		 545 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.22 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.2 
 
 		 495 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  27.34 
 
 		 534 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.15 
 
 		 549 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  23.33 
 
 		 521 aa  47.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.59 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.75 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.55 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  24.42 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.71 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>