33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1607 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 534 aa  1104    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  50.76 
 
 		 528 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  44.13 
 
 		 532 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  43.13 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  42.02 
 
 		 521 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  39.66 
 
 		 529 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  37.59 
 
 		 534 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  39.53 
 
 		 564 aa  336  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  39.11 
 
 		 520 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  39.74 
 
 		 535 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  36.93 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.33 
 
 		 520 aa  327  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  38.52 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.4 
 
 		 523 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  38.28 
 
 		 518 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  37.89 
 
 		 518 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  41.14 
 
 		 511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  37.93 
 
 		 511 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.2 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.55 
 
 		 546 aa  303  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.84 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  36.02 
 
 		 555 aa  299  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  39.13 
 
 		 508 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.84 
 
 		 529 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  36.77 
 
 		 519 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  36.58 
 
 		 511 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  29.43 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.35 
 
 		 502 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  28.33 
 
 		 502 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  28.06 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.34 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  24.71 
 
 		 488 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.83 
 
 		 555 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>