33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2630 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 573 aa  1152    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  39.3 
 
 		 516 aa  266  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.36 
 
 		 561 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.87 
 
 		 506 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.99 
 
 		 533 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  37.17 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.93 
 
 		 525 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.86 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  32.96 
 
 		 560 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.35 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.27 
 
 		 555 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  32.75 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.64 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  27.1 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.35 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.5 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.85 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.34 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.46 
 
 		 1540 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  28.65 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.35 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.1 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.92 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.53 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.54 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.35 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1418  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.52 
 
 		 519 aa  53.9  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.128485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.13 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.52 
 
 		 549 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.54 
 
 		 722 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2159  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.38 
 
 		 529 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0719403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17140  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.39 
 
 		 525 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.21 
 
 		 484 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>