34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0923 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 540 aa  1115    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  40.63 
 
 		 545 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.91 
 
 		 507 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.31 
 
 		 507 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.86 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  29.53 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.05 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.5 
 
 		 573 aa  80.5  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  26.6 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  32.16 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.45 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40.38 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.2 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2159  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.91 
 
 		 529 aa  67  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0719403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.8 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.66 
 
 		 567 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  33.64 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.45 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  35.45 
 
 		 502 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.84 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  30.37 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1418  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.99 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.128485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  26.86 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.5 
 
 		 722 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.48 
 
 		 506 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  31.5 
 
 		 550 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.76 
 
 		 1540 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  22.51 
 
 		 506 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.76 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.07 
 
 		 518 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.52 
 
 		 495 aa  50.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.22 
 
 		 573 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.75 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.63 
 
 		 529 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>