31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2573 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 560 aa  1121    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  48.63 
 
 		 561 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  47.49 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  46.8 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  45.9 
 
 		 1540 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  48.31 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.39 
 
 		 567 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.58 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  30.71 
 
 		 550 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  24.87 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.83 
 
 		 533 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  32.46 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.78 
 
 		 573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.16 
 
 		 517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.58 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.7 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.81 
 
 		 525 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  25 
 
 		 506 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  30.19 
 
 		 516 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.3 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.32 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.45 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.51 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.8 
 
 		 545 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.81 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.44 
 
 		 507 aa  63.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1418  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.3 
 
 		 519 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.128485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  28 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.34 
 
 		 722 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2159  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.64 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0719403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>