48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0650 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  100 
 
 		 525 aa  1077    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.17 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.93 
 
 		 561 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  28.91 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.58 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.37 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.75 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.4 
 
 		 561 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.91 
 
 		 518 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  27.68 
 
 		 550 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  29.44 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.84 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  24.69 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.69 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.02 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.29 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.4 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  27.67 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.97 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.04 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  24.47 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.53 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  27.65 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.94 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.49 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  25.9 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.49 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.08 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.7 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.7 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.34 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  24.11 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.01 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.51 
 
 		 549 aa  57  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  29.41 
 
 		 511 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  24.88 
 
 		 532 aa  54.3  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  21.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  22.47 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.13 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  25.92 
 
 		 518 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  25.63 
 
 		 518 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.23 
 
 		 1540 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  22.57 
 
 		 502 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  25.49 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.22 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  23.05 
 
 		 502 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.43 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  21.04 
 
 		 523 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>