39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1896 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 533 aa  1090    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.12 
 
 		 561 aa  203  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.79 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  33.82 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.99 
 
 		 573 aa  186  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.1 
 
 		 506 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.71 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.22 
 
 		 525 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.73 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.45 
 
 		 540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  30.34 
 
 		 516 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  31.89 
 
 		 550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.25 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.52 
 
 		 567 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.02 
 
 		 525 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.73 
 
 		 555 aa  123  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  31.27 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.4 
 
 		 561 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  30.85 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.95 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  25.52 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.79 
 
 		 1540 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.26 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.45 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.05 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.05 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.71 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.4 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.49 
 
 		 722 aa  74.3  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.74 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  25.18 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17140  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.1 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  24.82 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.45 
 
 		 502 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.67 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1418  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.26 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.128485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2159  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.86 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0719403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.85 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.33 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>