34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2680 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  69.93 
 
 		 555 aa  705    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  65.93 
 
 		 573 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  66.85 
 
 		 568 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 561 aa  1123    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  56.82 
 
 		 1540 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  48.62 
 
 		 560 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40.22 
 
 		 555 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.27 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.05 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  35.48 
 
 		 550 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  24.52 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.78 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  32.23 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.71 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.17 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.37 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.43 
 
 		 506 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.4 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.44 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.35 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.2 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.57 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  27.08 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.74 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.36 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.88 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.77 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.72 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.38 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.33 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  26.06 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  24.29 
 
 		 511 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  25 
 
 		 521 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.39 
 
 		 539 aa  44.3  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>