27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2671 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  73.77 
 
 		 507 aa  793    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 507 aa  1048    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1418  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.06 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.128485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2159  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.39 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0719403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.06 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.74 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.53 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.53 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.03 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  32.53 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  28.16 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.36 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.22 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.13 
 
 		 1540 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.36 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.14 
 
 		 525 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  28.48 
 
 		 550 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.58 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  31.19 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.17 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.8 
 
 		 555 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.39 
 
 		 540 aa  50.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  35 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  32.81 
 
 		 560 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.19 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.66 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.31 
 
 		 573 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>