30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3054 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 555 aa  1105    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  42.32 
 
 		 555 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  40.39 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  42.2 
 
 		 568 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  42.2 
 
 		 573 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  40.29 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.95 
 
 		 1540 aa  306  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  31.78 
 
 		 550 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.75 
 
 		 540 aa  163  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.9 
 
 		 567 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  24.07 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.98 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.7 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.9 
 
 		 517 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.29 
 
 		 518 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.68 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  31.38 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  30.03 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.99 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.35 
 
 		 525 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  29.1 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.4 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.4 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.92 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.23 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.9 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.1 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.17 
 
 		 507 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.41 
 
 		 507 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.83 
 
 		 534 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>