26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2439 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  100 
 
 		 525 aa  1083    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.93 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.57 
 
 		 561 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.78 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.95 
 
 		 517 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.83 
 
 		 1540 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  23.95 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  26.01 
 
 		 568 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.93 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000214368  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.34 
 
 		 555 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.9 
 
 		 506 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.7 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  0.000092711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  25.81 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.04 
 
 		 567 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.33 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.84 
 
 		 573 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  24.26 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  23.76 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000306277  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.26 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.35 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.53 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.5 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  22.86 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.3 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17140  CRISPR-associated protein, Cse1 family  21.17 
 
 		 525 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.08 
 
 		 722 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>