33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0864 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1106    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.93 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  37.23 
 
 		 564 aa  322  8e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  36.65 
 
 		 521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.23 
 
 		 539 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  36.02 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  33.39 
 
 		 528 aa  299  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.62 
 
 		 529 aa  293  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.96 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  37.61 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.49 
 
 		 520 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  33.88 
 
 		 511 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.42 
 
 		 520 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.49 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.47 
 
 		 523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  33.06 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.39 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  33.85 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.34 
 
 		 555 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  34.04 
 
 		 518 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.15 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  33.4 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.57 
 
 		 529 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.48 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.46 
 
 		 529 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  29.19 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.22 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  25.95 
 
 		 502 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  25.95 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.67 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  24.58 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.71 
 
 		 555 aa  43.9  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>