More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1371 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1371  ABC transporter related  100 
 
 
532 aa  1060    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1370  ABC transporter related  28.3 
 
 
535 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2082  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  25.15 
 
 
597 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0301189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  24.71 
 
 
599 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 
575 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  31.05 
 
 
575 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3506  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  39.05 
 
 
550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  25 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.21 
 
 
596 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.37 
 
 
597 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  24.12 
 
 
597 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3142  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  25.25 
 
 
585 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  26.82 
 
 
569 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  24.5 
 
 
721 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  27.46 
 
 
578 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.74 
 
 
582 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.98 
 
 
634 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  24.09 
 
 
739 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  23.34 
 
 
741 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  26.9 
 
 
574 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4373  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  25.05 
 
 
583 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  25.91 
 
 
597 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  26.16 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  26.38 
 
 
614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  23.81 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1648  ABC transporter related  38.74 
 
 
244 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.21 
 
 
618 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.2 
 
 
582 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  26.24 
 
 
598 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  27.12 
 
 
655 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.13 
 
 
600 aa  134  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.14 
 
 
639 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  29.12 
 
 
726 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 
619 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  27.34 
 
 
598 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.9 
 
 
596 aa  134  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  31.02 
 
 
541 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 
582 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.02 
 
 
568 aa  133  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  29.08 
 
 
618 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  32.85 
 
 
584 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.61 
 
 
574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0343  ABC transporter related  25.81 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  27.51 
 
 
611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  27.84 
 
 
590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 
720 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  24.91 
 
 
596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  27.36 
 
 
870 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  28.28 
 
 
595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  28.38 
 
 
584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  24.91 
 
 
573 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  24.91 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3466  efflux ABC transporter ATP-binding protein  24.52 
 
 
569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.61 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.61 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  24.91 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  24.91 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  26.53 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  25.88 
 
 
672 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  27.79 
 
 
584 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  25.64 
 
 
742 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  25.76 
 
 
598 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.09 
 
 
582 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  26.65 
 
 
647 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.88 
 
 
595 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  22.89 
 
 
607 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  24.72 
 
 
573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  24.91 
 
 
573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.07 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.8 
 
 
574 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  23.81 
 
 
577 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  24.88 
 
 
577 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2706  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
529 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.8 
 
 
574 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.31 
 
 
582 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.76 
 
 
582 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  27.52 
 
 
606 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  27.65 
 
 
654 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  24 
 
 
604 aa  130  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.86 
 
 
581 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  22.82 
 
 
642 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0553  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.81 
 
 
547 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0310925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.98 
 
 
600 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>