More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1648 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1648  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1715  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  38.64 
 
 		 579 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.989561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1983  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  38.36 
 
 		 579 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1410  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.75 
 
 		 573 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215982  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0801  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  38.82 
 
 		 573 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  37.44 
 
 		 609 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.75 
 
 		 573 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  35.75 
 
 		 573 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.01 
 
 		 581 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.75 
 
 		 573 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.75 
 
 		 573 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  35.75 
 
 		 573 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  38.22 
 
 		 581 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 		 609 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.11 
 
 		 578 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 706 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.12 
 
 		 611 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1021  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.45 
 
 		 573 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000555337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  39.46 
 
 		 606 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1070  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.45 
 
 		 573 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 616 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1370  ABC transporter related  41.67 
 
 		 535 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.75 
 
 		 573 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  39.55 
 
 		 582 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0961  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.45 
 
 		 573 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1055  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.45 
 
 		 573 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02608  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  38.46 
 
 		 574 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003746  transport ATP-binding protein CydC  38.46 
 
 		 573 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  38.29 
 
 		 606 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.29 
 
 		 573 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.87 
 
 		 579 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2757  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.29 
 
 		 573 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336134  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  34.65 
 
 		 579 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  37.22 
 
 		 573 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  36.73 
 
 		 595 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0989  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.45 
 
 		 573 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1003  ABC transporter related  40 
 
 		 565 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  37.89 
 
 		 609 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  36.12 
 
 		 609 aa  158  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  40.45 
 
 		 610 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  38.36 
 
 		 583 aa  158  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0959  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.29 
 
 		 573 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  36.94 
 
 		 590 aa  158  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  33.19 
 
 		 582 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1606  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  34.07 
 
 		 574 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2689  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  34.07 
 
 		 574 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 608 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2601  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  34.07 
 
 		 574 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 610 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 612 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.16 
 
 		 621 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  37.44 
 
 		 594 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.8 
 
 		 573 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  38.12 
 
 		 613 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  37.89 
 
 		 610 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.05 
 
 		 603 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  38.05 
 
 		 676 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 		 609 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  33.78 
 
 		 625 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  34.8 
 
 		 621 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  35.4 
 
 		 607 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  37.45 
 
 		 574 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  37.67 
 
 		 550 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1150  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.9 
 
 		 576 aa  154  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.91348  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 576 aa  154  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.78 
 
 		 573 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  36.04 
 
 		 749 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  35.59 
 
 		 585 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  38.74 
 
 		 455 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.36 
 
 		 612 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.77 
 
 		 577 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  36.04 
 
 		 590 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  36.04 
 
 		 590 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  34.8 
 
 		 609 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  34.8 
 
 		 609 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  34.3 
 
 		 610 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  34.8 
 
 		 609 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  35.68 
 
 		 609 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.8 
 
 		 609 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  34.36 
 
 		 609 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  36.52 
 
 		 594 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  35.5 
 
 		 613 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  32.92 
 
 		 619 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 1000 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  33.92 
 
 		 613 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0113  ABC transporter related  32.91 
 
 		 619 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  36.94 
 
 		 566 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  40.27 
 
 		 727 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  36.12 
 
 		 618 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0739  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  31.96 
 
 		 586 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0348008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  34.36 
 
 		 609 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  34.23 
 
 		 594 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  35.91 
 
 		 598 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 584 aa  151  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 566 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  36.94 
 
 		 746 aa  151  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  33.8 
 
 		 608 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2364  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.61 
 
 		 573 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.85 
 
 		 610 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  34.36 
 
 		 609 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>