105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0749 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  48.24 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  28.35 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  26.19 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  29.83 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1478  Urease accessory protein UreD  30.73 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0751352  normal  0.245102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  22.81 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  22.61 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  22.22 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  28.81 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  25.39 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  27.6 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  25.81 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  28 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  26.58 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  24.06 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  26.03 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  24.49 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  25.71 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  25.29 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  26.52 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  32 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  25.98 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  34.33 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  25.23 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  25.23 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1301  urease accessory protein UreD  21.93 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1463  Urease accessory protein UreD  21.93 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  22.37 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  21.88 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  24.6 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  26.4 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  26.58 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  25.96 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  25.96 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  24.64 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  24.76 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  25.28 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  24.58 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  29.84 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  27.16 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  26.13 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  29.11 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119681  urease accessory protein URED, putative  23.96 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  23.83 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  25.93 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  26.44 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  26.02 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0329  urease accessory protein  24.9 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  34.62 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  24.31 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  25.35 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  25.37 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  27.07 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  30.19 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  36.54 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  29.93 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  31.25 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  28 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  26.34 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  34.19 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  33.93 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  27.37 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  24.45 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  25.52 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  31.88 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  27.78 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  32.14 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  29.58 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  32.69 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  32.69 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4831  urease accessory protein UreD  25 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  26.36 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02144  urease accessory protein UreD (AFU_orthologue; AFUA_2G16070)  28.22 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  30.77 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  22 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  29.63 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  24.17 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1264  urease accessory protein  20.39 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  23.3 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  23.17 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  22.95 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  25.23 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  26.57 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  25.1 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  25.89 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  22.45 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  28.16 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  23.72 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  23.78 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  26.85 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  23.68 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  21.99 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  21.84 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48625  predicted protein  27.88 
 
 		 666 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>