148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3622 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 279 aa  577  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  60.07 
 
 		 284 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  40.74 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  36.36 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  37.04 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  38.29 
 
 		 296 aa  188  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  37.63 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  36.53 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  35.06 
 
 		 280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  35.06 
 
 		 280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  35.32 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  38.15 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  35.32 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  34.81 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  35.19 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  34.07 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  37.84 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  36.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  37.28 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  36.46 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  36.1 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  36.92 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  36.3 
 
 		 299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  36.23 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  36.59 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  36.56 
 
 		 295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  34.69 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  34.55 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  35.84 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  34.91 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  34.91 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  34.91 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  33 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  34.93 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  34.91 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  35.11 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  33.69 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  34.55 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 312 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  33.33 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  33.21 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  35.38 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  34.17 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  34.17 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  34.18 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  33.1 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  33.58 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  32.97 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  32.61 
 
 		 302 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  32.74 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  32.97 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  33.1 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  31.68 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  30.82 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  32.62 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  28.82 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  32.13 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  32.85 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  30.18 
 
 		 301 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  37.98 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  29.33 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  30.55 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08921  urease accessory protein UreD  30.26 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00733999  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  30 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  33.47 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  33.17 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  32.93 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  33.21 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  32.79 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  36.05 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  32.54 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  36.14 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  30.28 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  32.53 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  31.12 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  32.62 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  32.62 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  32.45 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  30.53 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  28.46 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  38.01 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  26.36 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  30.15 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  30.95 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  29.89 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  35.39 
 
 		 250 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  37.88 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  28.24 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  30.13 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  25.97 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  35.12 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  29.87 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  29.13 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>