73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6444 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6444  urease accessory protein  100 
 
 		 270 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31216  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  43.44 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0830  putative urease accessory protein  35.56 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5702  putative urease accessory protein UreD  37.23 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03280  urease accessory protein UreH  38.83 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0502  urease accessory protein UreD  38.37 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0194  putative urease accessory protein  38.58 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11881  urease accessory protein ureD  36.3 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2846  putative urease accessory protein  38.97 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2829  putative urease accessory protein  38.97 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2802  putative urease accessory protein  38.97 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3079  putative urease accessory protein  36.3 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0546713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0275  Urease accessory protein UreH-like protein  38.1 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2752  hypothetical protein  34.75 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0794267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0694  Urease accessory protein UreH-like protein  31.58 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0135434  hitchhiker  0.0000000541672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  33.12 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  29.77 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3507  Urease accessory protein UreH-like protein  31.29 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  31.22 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  29.45 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  32.65 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  32.84 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3349  putative urease accessory protein  33.58 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  32.6 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  32.98 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  32.93 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  30.43 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  32.93 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  27.06 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  31.88 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3406  putative urease accessory protein  27.01 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  29.75 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  25.64 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  31.75 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  29.81 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  31.12 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  25.9 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  25.9 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  30.28 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  31.1 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  28.57 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  30.77 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  29.81 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  29.69 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  27.92 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  29.69 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  29.81 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  27.21 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  30.37 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  30.11 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  30.43 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  27.65 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0693  hypothetical protein  29.03 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0249128  hitchhiker  0.0000000487689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  29.32 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  27.74 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  24.86 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  27.56 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  28.17 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3057  Urease accessory protein UreD  28.83 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  29.32 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  24.47 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  27.5 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  24.62 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  32.28 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3313  Urease accessory protein UreD  25.93 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  27.39 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  24.51 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  25.17 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  26.54 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  28.26 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  23.71 
 
 		 288 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  26.15 
 
 		 295 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>